A MATE Szent István Campuson az alábbi mesterképzések érhetők el:
Agrár- és környezettudományi terület:
- Állattenyésztő mérnök MSc
- Környezetgazdálkodási agrármérnök MSc
- Környezetmérnök MSc
- Mezőgazdasági biotechnológus MSc
- Mezőgazdasági vízgazdálkodási mérnök MSc
- Növényorvos MSc
- Növénytermesztő mérnök MSc
- Ökológiai gazdálkodási mérnök MSc (kifutó képzés)
- Takarmányozási és takarmánybiztonsági mérnök MSc
- Természetvédelmi mérnök MSc
- Vadgazda mérnök MSc
Gazdaságtudományi terület:
- Ellátásilánc-menedzsment MSc (korábban Logisztikai menedzsment MSc)
- Nemzetközi gazdaság és gazdálkodás MA
- Marketing MSc
- Pénzügy MSc
- Regionális és környezeti gazdaságtan MA
- Turizmus-menedzsment MSc
- Vezetés és szervezés MSc
- Vidékfejlesztési agrármérnök MSc
Műszaki terület:
- Gépészmérnök MSc
- Létesítménymérnök MSc
- Mezőgazdasági és élelmiszeripari gépészmérnök MSc
- Műszaki menedzser MSc
Bölcsészettudományi és pedagógiai terület:
- Agrármérnöktanár MA (Jelentkezési lap a 2 féléves szeptemberben induló levelező képzésre)
- Emberi erőforrás tanácsadó MA
- Párhuzamos agrármérnöktanár MA